Description du test

Les sérogroupes pathogènes produisent la toxine cholérique, alors que les souches non pathogènes peuvent ou non produire cette toxine.

Le bactériophage filamenteux Ctx confère aux souches de Vibrion cholerae (V. cholerae), l’opéron Ctx, portant les gènes CtxA et CtxB. La transmission se fait par un transfert horizontal, avec intégration de l’opéron dans le génome bactérien qui est alors capable de produire la toxine cholérique conférant une pathogénicité à la bactérie. Cette toxine cholérique sera notamment responsable de symptômes diarrhéiques pouvant mettre en péril le pronostic vital. Dans le cadre des activités du centre national de référence, une PCR en temps réel a été développée pour détecter les souches de V. cholerae virulentes (responsables du choléra) en ciblant une portion de l’opéron Ctx (gène CtxA).
Amplification de gènes ‘ CtxA’ par PCR en temps réel.
Le gène TCPA  code pour un pilus assimilable à de l'adhésine qui se situe à l'extrémité du corps bactérien et permet à la bactérie d'adhérer aux cellules intestinales. ces memes pili sont également les  récepteurs des bactériophages Ctx.
Amplification du gène TcpA par PCR.
 

But du test

 Détection de la toxine cholérique CtxA et de TcpA, facteurs de virulence des V.cholerae.

 

Critères pour effectuer ce test

 Toute souche de Vibrio reçue et confirmée V.cholerae par le CNR et isolée de prélèvements humains.

 

Instructions sur l'échantillon

A partir d’une culture de la souche de V.cholerae à envoyer, préparation d’une sous-culture fraîche et pure sur un milieu nutritif et envoi soit sur la gelose en boîte, soit après inoculation massive en profondeur dans une gélose nutritive en tube, soit sur écouvillon dans son milieu de transport après avoir récolté la sous-culture.

 

Instructions sur le transport

 La souche doit être conditionnée dans un milieu de transport adapté (boîte ou tube gélosé, écouvillon avec milieu de transport) et correctement identifiée.

Acheminement dans un triple emballage :

  • Boîtes et tubes bien fermés hermétiquement ;
  • Emballage avec un matériel adsorbant dans un emballage secondaire (étui de type "transportblister ", containers plastiques ou sac en plastique à fermeture à glissière) ;
  • Le tout ensuite placé dans une enveloppe matelassée ou une boîte.
  • Aussi rapidement que possible à T° ambiante, dans les 72 heures après la préparation.
  • Etiquetage et conditions de transport conformes à la règlementation en vigueur concernant les matières infectieuses.
  • Pour chaque souche, le formulaire de demande (téléchargeable sur le site des CNR de l’ISP) doit obligatoirement être rempli avec le plus de précisions possibles et joint à chaque souche envoyée.

 

Demandes non acceptées

Les critères suivants serviront à rejeter un échantillon :
  • échantillon non identifié,
  • formulaire de demande incomplet,
  • conditions évidentes de conservation ou de transport inappropriées,
  • identification de V.cholerae non confirmée.

 

Délai pour recevoir le résultat

  • Fréquence d’analyse : à la demande.
  • Délai la détection : 48 heures.
  • Jours d’analyse : tous les jours ouvrables du lundi au vendredi.

 

Communication des résultats des tests

  • Comment : communication téléphonique (1) et compte-rendu papier par la poste (2) ou compterendu électronique (3).
  • Quand : lorsque des résultats pertinents d’analyses (même partiels) sont connus (téléphone, email : 1 ou 3), lorsque tous les résultats d’analyses sont connus (rapport écrit: 2 ou 3)
  • Résumé de tous les résultats disponibles dans le rapport annuel.