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Description du test

 La méthode MLST (Multilocus Sequence Typing) fait appel aux techniques modernes de biologie moléculaire. Elle permet le typage génétique par le séquençage de régions d'environ 500 paires de bases provenant de 7 gènes ubiquitaires. Les gènes ciblés sont adhP (alcool deshydrogènase), ATR (transporteur d'acides aminés), glcK (glucose kinase), glnA (glutamine synthètase), pheS (phénylalanine ARNt sythètase), sdhA (sérine deshydratase) et tkt (transkétolase). Les résultats du séquençage sont soumis à une base donnée spécifique pour S. agalactiae conférant un code et un "sequence type" (ST) à la souche traitée.

 

But du test

Cette technique est particulièrement intéressante chez des patients avec une présentation clinique particulièrement virulente. On sait notamment que le ST17 est souvent associé à une présentation clinique extreme.

 

Critères pour effectuer ce test

  • Souches de SGB isolées de sites normalement stériles ou de sites profonds lors d’une infection invasive et envoyées régulièrement au CNR à des fins de typage du CPS et de surveillance.
  • Souches de SGB isolées de porteurs sains dans le cadre d’un protocole spécifique de surveillance.
  • Ensemble de souches de SGB isolées de divers prélèvements pendant une suspicion d’épidémie et envoyées après un contact avec le CNR

 

Instructions sur l'échantillon

  • Une sous-culture fraîche sur gélose au sang ou une inoculation massive en profondeur dans une gélose nutritive ou une sous-culture pure fraîche et abondante récoltée sur un écouvillon avec son milieu de transport.
    Aussi rapidement que possible à T° ambiante, dans les 72 heures après la préparation.
    Etiquetage et conditions conformes aux règles concernant les échantillons infectieux – récipient/emballage étanche

 

Demande non acceptée

  • Les critères suivants serviront à rejeter un échantillon :
  • en dehors des critères de sélection,
  • fuite du milieu de transport,
  • échantillon non identifié,
  • champs obligatoires sur le formulaire de demande incomplètement remplis,
  • conditions évidentes de conservation ou de transport inapproprié.

 

Délai pour recevoir le résultat

1-4 semaines. effectué par série ou sur demande spécifique

 

Communication des résultats des tests

Compte-rendu papier par la poste ou compte-rendu électronique.
Tous les résultats disponibles résumés dans le rapport annuel.